Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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