Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCINQ13939 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCINQ13939 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCINQ13939 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCINQ13939 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCINQ13939 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCINQ13939 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCINQ13939 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCINQ13939 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCINQ13939 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCINQ13939 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCINQ13939 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCINQ13939 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCINQ13939 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCINQ13939 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCINQ13939 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCINQ13939 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCINQ13939 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCINQ13939 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCINQ13939 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCINQ13939 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCINQ13939 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCINQ13939 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCINQ13939 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCINQ13939 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCINQ13939 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCINQ13939 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCINQ13939 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCINQ13939 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCINQ13939 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCINQ13939 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCINQ13939 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCINQ13939 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCINQ13939 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCINQ13939 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCINQ13939 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCINQ13939 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCINQ13939 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCINQ13939 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCINQ13939 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCINQ13939 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCINQ13939 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCINQ13939 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCINQ13939 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCINQ13939 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCINQ13939 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCINQ13939 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCINQ13939 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCINQ13939 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCINQ13939 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCINQ13939 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCINQ13939 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCINQ13939 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCINQ13939 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCINQ13939 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCINQ13939 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCINQ13939 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCINQ13939 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCINQ13939 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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CCINQ13939 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCINQ13939 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCINQ13939 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCINQ13939 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCINQ13939 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCINQ13939 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCINQ13939 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCINQ13939 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCINQ13939 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCINQ13939 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCINQ13939 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCINQ13939 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCINQ13939 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCINQ13939 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCINQ13939 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCINQ13939 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCINQ13939 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCINQ13939 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCINQ13939 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCINQ13939 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCINQ13939 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCINQ13939 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCINQ13939 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCINQ13939 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCINQ13939 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCINQ13939 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCINQ13939 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCINQ13939 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCINQ13939 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCINQ13939 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCINQ13939 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCINQ13939 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCINQ13939 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCINQ13939 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCINQ13939 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCINQ13939 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCINQ13939 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCINQ13939 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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