Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
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