Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

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Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
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