Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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CUL4AQ13619 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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