Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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DNASE1L3Q13609 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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