Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms