Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms