Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms