Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms