Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms