Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FMODQ06828 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FMODQ06828 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FMODQ06828 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FMODQ06828 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FMODQ06828 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FMODQ06828 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FMODQ06828 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FMODQ06828 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FMODQ06828 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FMODQ06828 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FMODQ06828 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FMODQ06828 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FMODQ06828 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FMODQ06828 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FMODQ06828 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FMODQ06828 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FMODQ06828 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FMODQ06828 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FMODQ06828 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FMODQ06828 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FMODQ06828 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FMODQ06828 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FMODQ06828 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FMODQ06828 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FMODQ06828 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FMODQ06828 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FMODQ06828 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FMODQ06828 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FMODQ06828 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FMODQ06828 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FMODQ06828 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FMODQ06828 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FMODQ06828 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FMODQ06828 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FMODQ06828 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FMODQ06828 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FMODQ06828 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FMODQ06828 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FMODQ06828 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FMODQ06828 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FMODQ06828 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FMODQ06828 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FMODQ06828 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FMODQ06828 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FMODQ06828 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FMODQ06828 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FMODQ06828 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FMODQ06828 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FMODQ06828 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FMODQ06828 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FMODQ06828 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FMODQ06828 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FMODQ06828 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FMODQ06828 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FMODQ06828 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FMODQ06828 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FMODQ06828 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FMODQ06828 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FMODQ06828 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FMODQ06828 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FMODQ06828 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FMODQ06828 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FMODQ06828 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FMODQ06828 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FMODQ06828 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FMODQ06828 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FMODQ06828 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FMODQ06828 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FMODQ06828 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FMODQ06828 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FMODQ06828 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FMODQ06828 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FMODQ06828 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FMODQ06828 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FMODQ06828 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FMODQ06828 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FMODQ06828 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FMODQ06828 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FMODQ06828 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FMODQ06828 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FMODQ06828 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FMODQ06828 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FMODQ06828 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
FMODQ06828 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
FMODQ06828 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
FMODQ06828 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FMODQ06828 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FMODQ06828 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FMODQ06828 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FMODQ06828 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FMODQ06828 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FMODQ06828 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FMODQ06828 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FMODQ06828 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FMODQ06828 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FMODQ06828 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FMODQ06828 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FMODQ06828 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FMODQ06828 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms