Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms