Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms