Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms