Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms