Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms