Protein–RNA interactions for Protein: P62820

RAB1A, Ras-related protein Rab-1A, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1AP62820 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms