Protein–RNA interactions for Protein: P57775

FBXW4, F-box/WD repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW4P57775 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms