Protein–RNA interactions for Protein: P56524

HDAC4, Histone deacetylase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC4P56524 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC4P56524 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms