Protein–RNA interactions for Protein: P50402

EMD, Emerin, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMDP50402 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMDP50402 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMDP50402 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMDP50402 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMDP50402 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMDP50402 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMDP50402 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMDP50402 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMDP50402 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMDP50402 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMDP50402 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMDP50402 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMDP50402 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMDP50402 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMDP50402 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EMDP50402 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMDP50402 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMDP50402 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMDP50402 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMDP50402 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMDP50402 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMDP50402 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMDP50402 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMDP50402 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMDP50402 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMDP50402 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMDP50402 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMDP50402 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMDP50402 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMDP50402 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMDP50402 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMDP50402 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMDP50402 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMDP50402 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMDP50402 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMDP50402 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMDP50402 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMDP50402 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EMDP50402 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMDP50402 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMDP50402 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMDP50402 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMDP50402 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMDP50402 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMDP50402 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMDP50402 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMDP50402 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMDP50402 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMDP50402 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMDP50402 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMDP50402 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMDP50402 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMDP50402 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMDP50402 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMDP50402 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMDP50402 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMDP50402 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMDP50402 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMDP50402 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMDP50402 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMDP50402 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMDP50402 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMDP50402 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMDP50402 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMDP50402 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMDP50402 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMDP50402 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMDP50402 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMDP50402 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMDP50402 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMDP50402 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMDP50402 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMDP50402 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMDP50402 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMDP50402 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMDP50402 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMDP50402 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMDP50402 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMDP50402 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMDP50402 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMDP50402 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMDP50402 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMDP50402 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMDP50402 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMDP50402 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EMDP50402 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMDP50402 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMDP50402 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMDP50402 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMDP50402 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMDP50402 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMDP50402 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMDP50402 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMDP50402 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMDP50402 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMDP50402 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMDP50402 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EMDP50402 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMDP50402 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMDP50402 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms