Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ME1P48163 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ME1P48163 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ME1P48163 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ME1P48163 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ME1P48163 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ME1P48163 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ME1P48163 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ME1P48163 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ME1P48163 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ME1P48163 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ME1P48163 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ME1P48163 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ME1P48163 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ME1P48163 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ME1P48163 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ME1P48163 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ME1P48163 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ME1P48163 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ME1P48163 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ME1P48163 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ME1P48163 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ME1P48163 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ME1P48163 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ME1P48163 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ME1P48163 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ME1P48163 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ME1P48163 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ME1P48163 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ME1P48163 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ME1P48163 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ME1P48163 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ME1P48163 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ME1P48163 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ME1P48163 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ME1P48163 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ME1P48163 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ME1P48163 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ME1P48163 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ME1P48163 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ME1P48163 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ME1P48163 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ME1P48163 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ME1P48163 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
ME1P48163 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ME1P48163 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ME1P48163 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ME1P48163 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ME1P48163 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ME1P48163 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ME1P48163 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ME1P48163 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ME1P48163 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ME1P48163 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ME1P48163 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ME1P48163 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ME1P48163 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ME1P48163 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ME1P48163 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ME1P48163 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ME1P48163 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ME1P48163 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ME1P48163 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ME1P48163 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ME1P48163 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ME1P48163 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ME1P48163 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ME1P48163 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ME1P48163 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ME1P48163 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ME1P48163 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ME1P48163 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ME1P48163 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ME1P48163 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ME1P48163 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ME1P48163 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ME1P48163 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ME1P48163 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ME1P48163 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ME1P48163 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ME1P48163 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ME1P48163 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ME1P48163 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ME1P48163 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ME1P48163 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ME1P48163 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ME1P48163 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ME1P48163 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ME1P48163 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ME1P48163 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ME1P48163 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ME1P48163 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ME1P48163 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ME1P48163 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ME1P48163 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ME1P48163 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ME1P48163 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ME1P48163 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ME1P48163 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ME1P48163 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms