Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA1P17302 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA1P17302 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA1P17302 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA1P17302 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA1P17302 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA1P17302 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA1P17302 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA1P17302 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA1P17302 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA1P17302 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA1P17302 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA1P17302 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA1P17302 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA1P17302 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA1P17302 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA1P17302 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA1P17302 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA1P17302 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA1P17302 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA1P17302 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA1P17302 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA1P17302 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA1P17302 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA1P17302 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA1P17302 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA1P17302 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA1P17302 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA1P17302 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA1P17302 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA1P17302 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA1P17302 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA1P17302 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA1P17302 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA1P17302 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA1P17302 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA1P17302 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA1P17302 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA1P17302 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA1P17302 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA1P17302 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA1P17302 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA1P17302 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA1P17302 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA1P17302 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA1P17302 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA1P17302 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA1P17302 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA1P17302 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA1P17302 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA1P17302 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA1P17302 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA1P17302 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA1P17302 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA1P17302 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA1P17302 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA1P17302 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA1P17302 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA1P17302 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA1P17302 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA1P17302 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA1P17302 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA1P17302 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA1P17302 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA1P17302 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA1P17302 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA1P17302 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA1P17302 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA1P17302 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA1P17302 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA1P17302 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA1P17302 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA1P17302 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA1P17302 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA1P17302 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA1P17302 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA1P17302 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA1P17302 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA1P17302 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA1P17302 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA1P17302 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA1P17302 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA1P17302 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA1P17302 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA1P17302 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA1P17302 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA1P17302 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA1P17302 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA1P17302 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA1P17302 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA1P17302 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA1P17302 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA1P17302 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA1P17302 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA1P17302 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA1P17302 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA1P17302 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA1P17302 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA1P17302 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA1P17302 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms