Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB1P16220 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB1P16220 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB1P16220 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB1P16220 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB1P16220 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB1P16220 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB1P16220 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB1P16220 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB1P16220 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB1P16220 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB1P16220 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB1P16220 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB1P16220 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB1P16220 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB1P16220 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB1P16220 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB1P16220 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB1P16220 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB1P16220 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB1P16220 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB1P16220 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB1P16220 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB1P16220 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB1P16220 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB1P16220 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB1P16220 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB1P16220 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB1P16220 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB1P16220 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB1P16220 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB1P16220 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB1P16220 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB1P16220 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB1P16220 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB1P16220 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB1P16220 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB1P16220 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB1P16220 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB1P16220 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB1P16220 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB1P16220 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB1P16220 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB1P16220 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB1P16220 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB1P16220 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB1P16220 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB1P16220 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB1P16220 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB1P16220 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB1P16220 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CREB1P16220 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CREB1P16220 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CREB1P16220 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CREB1P16220 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CREB1P16220 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CREB1P16220 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CREB1P16220 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CREB1P16220 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CREB1P16220 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CREB1P16220 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CREB1P16220 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CREB1P16220 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CREB1P16220 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CREB1P16220 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CREB1P16220 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CREB1P16220 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CREB1P16220 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CREB1P16220 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CREB1P16220 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CREB1P16220 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CREB1P16220 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CREB1P16220 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CREB1P16220 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CREB1P16220 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CREB1P16220 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CREB1P16220 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CREB1P16220 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CREB1P16220 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CREB1P16220 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CREB1P16220 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CREB1P16220 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CREB1P16220 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CREB1P16220 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CREB1P16220 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CREB1P16220 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CREB1P16220 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CREB1P16220 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CREB1P16220 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CREB1P16220 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CREB1P16220 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CREB1P16220 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CREB1P16220 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CREB1P16220 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CREB1P16220 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CREB1P16220 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CREB1P16220 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CREB1P16220 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CREB1P16220 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CREB1P16220 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms