Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms