Protein–RNA interactions for Protein: P09919

CSF3, Granulocyte colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3P09919 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF3P09919 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF3P09919 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF3P09919 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF3P09919 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3P09919 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3P09919 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3P09919 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3P09919 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3P09919 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3P09919 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3P09919 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3P09919 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3P09919 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3P09919 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3P09919 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3P09919 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3P09919 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3P09919 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3P09919 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3P09919 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3P09919 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3P09919 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3P09919 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3P09919 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3P09919 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3P09919 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3P09919 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3P09919 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3P09919 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3P09919 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3P09919 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3P09919 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3P09919 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3P09919 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3P09919 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3P09919 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3P09919 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3P09919 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3P09919 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3P09919 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3P09919 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3P09919 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF3P09919 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF3P09919 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF3P09919 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF3P09919 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF3P09919 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF3P09919 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF3P09919 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF3P09919 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF3P09919 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF3P09919 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF3P09919 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF3P09919 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF3P09919 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF3P09919 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF3P09919 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF3P09919 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF3P09919 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF3P09919 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF3P09919 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF3P09919 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF3P09919 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF3P09919 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF3P09919 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF3P09919 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF3P09919 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF3P09919 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF3P09919 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF3P09919 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF3P09919 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF3P09919 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF3P09919 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF3P09919 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF3P09919 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF3P09919 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF3P09919 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF3P09919 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF3P09919 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF3P09919 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF3P09919 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF3P09919 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF3P09919 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF3P09919 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF3P09919 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF3P09919 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF3P09919 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF3P09919 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSF3P09919 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSF3P09919 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSF3P09919 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSF3P09919 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSF3P09919 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSF3P09919 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSF3P09919 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSF3P09919 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSF3P09919 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSF3P09919 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSF3P09919 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms