Protein–RNA interactions for Protein: P07948

LYN, Tyrosine-protein kinase Lyn, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNP07948 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LYNP07948 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LYNP07948 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LYNP07948 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LYNP07948 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LYNP07948 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LYNP07948 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LYNP07948 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LYNP07948 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LYNP07948 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LYNP07948 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LYNP07948 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LYNP07948 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LYNP07948 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LYNP07948 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LYNP07948 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LYNP07948 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LYNP07948 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LYNP07948 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LYNP07948 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LYNP07948 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LYNP07948 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LYNP07948 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LYNP07948 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LYNP07948 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LYNP07948 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LYNP07948 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LYNP07948 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LYNP07948 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LYNP07948 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LYNP07948 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LYNP07948 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LYNP07948 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LYNP07948 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LYNP07948 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LYNP07948 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LYNP07948 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LYNP07948 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LYNP07948 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LYNP07948 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LYNP07948 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LYNP07948 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LYNP07948 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LYNP07948 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LYNP07948 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LYNP07948 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LYNP07948 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LYNP07948 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LYNP07948 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LYNP07948 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LYNP07948 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LYNP07948 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LYNP07948 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LYNP07948 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LYNP07948 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LYNP07948 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LYNP07948 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LYNP07948 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LYNP07948 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LYNP07948 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LYNP07948 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LYNP07948 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LYNP07948 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LYNP07948 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LYNP07948 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LYNP07948 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LYNP07948 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LYNP07948 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LYNP07948 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LYNP07948 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LYNP07948 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LYNP07948 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LYNP07948 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LYNP07948 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LYNP07948 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LYNP07948 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LYNP07948 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LYNP07948 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LYNP07948 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LYNP07948 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LYNP07948 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LYNP07948 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LYNP07948 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LYNP07948 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LYNP07948 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LYNP07948 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LYNP07948 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LYNP07948 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LYNP07948 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LYNP07948 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LYNP07948 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LYNP07948 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LYNP07948 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LYNP07948 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LYNP07948 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LYNP07948 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LYNP07948 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LYNP07948 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LYNP07948 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LYNP07948 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms