Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SYF2O95926 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SYF2O95926 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYF2O95926 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYF2O95926 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYF2O95926 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYF2O95926 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYF2O95926 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYF2O95926 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYF2O95926 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYF2O95926 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYF2O95926 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SYF2O95926 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYF2O95926 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYF2O95926 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYF2O95926 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SYF2O95926 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYF2O95926 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYF2O95926 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYF2O95926 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYF2O95926 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYF2O95926 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYF2O95926 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYF2O95926 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SYF2O95926 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYF2O95926 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYF2O95926 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYF2O95926 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYF2O95926 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYF2O95926 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYF2O95926 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYF2O95926 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYF2O95926 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYF2O95926 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYF2O95926 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYF2O95926 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYF2O95926 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYF2O95926 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SYF2O95926 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYF2O95926 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SYF2O95926 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SYF2O95926 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYF2O95926 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYF2O95926 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SYF2O95926 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYF2O95926 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYF2O95926 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYF2O95926 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYF2O95926 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYF2O95926 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYF2O95926 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYF2O95926 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYF2O95926 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYF2O95926 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYF2O95926 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYF2O95926 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYF2O95926 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYF2O95926 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYF2O95926 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYF2O95926 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SYF2O95926 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYF2O95926 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYF2O95926 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYF2O95926 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYF2O95926 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYF2O95926 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYF2O95926 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYF2O95926 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYF2O95926 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYF2O95926 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYF2O95926 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYF2O95926 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYF2O95926 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYF2O95926 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYF2O95926 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYF2O95926 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYF2O95926 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYF2O95926 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SYF2O95926 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYF2O95926 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYF2O95926 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYF2O95926 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYF2O95926 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYF2O95926 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYF2O95926 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYF2O95926 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYF2O95926 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYF2O95926 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYF2O95926 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYF2O95926 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYF2O95926 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYF2O95926 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYF2O95926 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYF2O95926 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYF2O95926 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYF2O95926 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYF2O95926 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYF2O95926 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYF2O95926 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYF2O95926 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms