Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCATO75600 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GCATO75600 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GCATO75600 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCATO75600 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCATO75600 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCATO75600 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCATO75600 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GCATO75600 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCATO75600 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCATO75600 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCATO75600 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCATO75600 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCATO75600 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCATO75600 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCATO75600 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCATO75600 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCATO75600 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCATO75600 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCATO75600 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCATO75600 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCATO75600 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCATO75600 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCATO75600 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCATO75600 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCATO75600 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCATO75600 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GCATO75600 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCATO75600 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCATO75600 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCATO75600 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCATO75600 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCATO75600 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCATO75600 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCATO75600 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCATO75600 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCATO75600 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCATO75600 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCATO75600 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCATO75600 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCATO75600 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCATO75600 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCATO75600 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCATO75600 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCATO75600 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCATO75600 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCATO75600 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCATO75600 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCATO75600 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCATO75600 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCATO75600 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GCATO75600 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCATO75600 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCATO75600 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCATO75600 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCATO75600 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCATO75600 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCATO75600 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCATO75600 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCATO75600 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCATO75600 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCATO75600 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCATO75600 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCATO75600 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCATO75600 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCATO75600 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCATO75600 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCATO75600 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCATO75600 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCATO75600 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCATO75600 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCATO75600 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCATO75600 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCATO75600 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCATO75600 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCATO75600 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCATO75600 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCATO75600 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCATO75600 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCATO75600 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCATO75600 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCATO75600 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCATO75600 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCATO75600 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCATO75600 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCATO75600 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCATO75600 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCATO75600 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCATO75600 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCATO75600 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCATO75600 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCATO75600 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GCATO75600 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GCATO75600 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GCATO75600 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GCATO75600 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GCATO75600 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GCATO75600 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GCATO75600 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GCATO75600 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms