Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
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