Protein–RNA interactions for Protein: O14828

SCAMP3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP3O14828 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCAMP3O14828 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms