Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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