Protein–RNA interactions for Protein: F8WFD2

NPIPA3, Nuclear pore complex-interacting protein family member A3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA3F8WFD2 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA3F8WFD2 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA3F8WFD2 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA3F8WFD2 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA3F8WFD2 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA3F8WFD2 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA3F8WFD2 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA3F8WFD2 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA3F8WFD2 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA3F8WFD2 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA3F8WFD2 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA3F8WFD2 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA3F8WFD2 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA3F8WFD2 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA3F8WFD2 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA3F8WFD2 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA3F8WFD2 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA3F8WFD2 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA3F8WFD2 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA3F8WFD2 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA3F8WFD2 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA3F8WFD2 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA3F8WFD2 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA3F8WFD2 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA3F8WFD2 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA3F8WFD2 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA3F8WFD2 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA3F8WFD2 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA3F8WFD2 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA3F8WFD2 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPIPA3F8WFD2 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
NPIPA3F8WFD2 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPIPA3F8WFD2 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPIPA3F8WFD2 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPIPA3F8WFD2 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPIPA3F8WFD2 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPIPA3F8WFD2 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPIPA3F8WFD2 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPIPA3F8WFD2 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA3F8WFD2 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA3F8WFD2 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA3F8WFD2 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA3F8WFD2 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA3F8WFD2 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA3F8WFD2 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA3F8WFD2 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA3F8WFD2 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA3F8WFD2 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA3F8WFD2 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA3F8WFD2 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA3F8WFD2 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA3F8WFD2 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA3F8WFD2 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA3F8WFD2 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA3F8WFD2 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA3F8WFD2 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA3F8WFD2 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA3F8WFD2 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA3F8WFD2 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA3F8WFD2 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA3F8WFD2 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA3F8WFD2 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA3F8WFD2 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA3F8WFD2 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA3F8WFD2 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA3F8WFD2 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA3F8WFD2 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA3F8WFD2 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA3F8WFD2 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA3F8WFD2 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA3F8WFD2 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA3F8WFD2 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA3F8WFD2 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA3F8WFD2 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA3F8WFD2 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA3F8WFD2 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA3F8WFD2 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA3F8WFD2 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA3F8WFD2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPA3F8WFD2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPA3F8WFD2 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPA3F8WFD2 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPA3F8WFD2 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPA3F8WFD2 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPA3F8WFD2 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPA3F8WFD2 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPA3F8WFD2 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPA3F8WFD2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPA3F8WFD2 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPA3F8WFD2 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPA3F8WFD2 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPA3F8WFD2 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPA3F8WFD2 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPA3F8WFD2 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPA3F8WFD2 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPA3F8WFD2 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPA3F8WFD2 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPA3F8WFD2 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPA3F8WFD2 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPA3F8WFD2 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms