Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC61Q9Y6R9 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC61Q9Y6R9 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC61Q9Y6R9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC61Q9Y6R9 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC61Q9Y6R9 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC61Q9Y6R9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC61Q9Y6R9 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC61Q9Y6R9 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC61Q9Y6R9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC61Q9Y6R9 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC61Q9Y6R9 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC61Q9Y6R9 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC61Q9Y6R9 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC61Q9Y6R9 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC61Q9Y6R9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC61Q9Y6R9 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC61Q9Y6R9 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC61Q9Y6R9 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC61Q9Y6R9 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC61Q9Y6R9 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC61Q9Y6R9 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC61Q9Y6R9 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC61Q9Y6R9 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC61Q9Y6R9 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC61Q9Y6R9 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC61Q9Y6R9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC61Q9Y6R9 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC61Q9Y6R9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC61Q9Y6R9 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC61Q9Y6R9 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC61Q9Y6R9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC61Q9Y6R9 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC61Q9Y6R9 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC61Q9Y6R9 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC61Q9Y6R9 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC61Q9Y6R9 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC61Q9Y6R9 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC61Q9Y6R9 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC61Q9Y6R9 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC61Q9Y6R9 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC61Q9Y6R9 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC61Q9Y6R9 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC61Q9Y6R9 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC61Q9Y6R9 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC61Q9Y6R9 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC61Q9Y6R9 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC61Q9Y6R9 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC61Q9Y6R9 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC61Q9Y6R9 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC61Q9Y6R9 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC61Q9Y6R9 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC61Q9Y6R9 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC61Q9Y6R9 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC61Q9Y6R9 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC61Q9Y6R9 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC61Q9Y6R9 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC61Q9Y6R9 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC61Q9Y6R9 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC61Q9Y6R9 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC61Q9Y6R9 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC61Q9Y6R9 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC61Q9Y6R9 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC61Q9Y6R9 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC61Q9Y6R9 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC61Q9Y6R9 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC61Q9Y6R9 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC61Q9Y6R9 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC61Q9Y6R9 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC61Q9Y6R9 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC61Q9Y6R9 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC61Q9Y6R9 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC61Q9Y6R9 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC61Q9Y6R9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC61Q9Y6R9 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC61Q9Y6R9 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC61Q9Y6R9 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC61Q9Y6R9 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC61Q9Y6R9 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC61Q9Y6R9 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC61Q9Y6R9 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC61Q9Y6R9 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC61Q9Y6R9 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC61Q9Y6R9 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC61Q9Y6R9 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC61Q9Y6R9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC61Q9Y6R9 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC61Q9Y6R9 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC61Q9Y6R9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC61Q9Y6R9 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC61Q9Y6R9 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC61Q9Y6R9 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC61Q9Y6R9 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC61Q9Y6R9 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC61Q9Y6R9 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC61Q9Y6R9 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC61Q9Y6R9 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC61Q9Y6R9 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC61Q9Y6R9 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC61Q9Y6R9 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms