Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q9

NCOA3, Nuclear receptor coactivator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA3Q9Y6Q9 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms