Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms