Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms