Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms