Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NUDCQ9Y266 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NUDCQ9Y266 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NUDCQ9Y266 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NUDCQ9Y266 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NUDCQ9Y266 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NUDCQ9Y266 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NUDCQ9Y266 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUDCQ9Y266 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUDCQ9Y266 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUDCQ9Y266 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUDCQ9Y266 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUDCQ9Y266 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUDCQ9Y266 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUDCQ9Y266 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NUDCQ9Y266 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUDCQ9Y266 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NUDCQ9Y266 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NUDCQ9Y266 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NUDCQ9Y266 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUDCQ9Y266 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUDCQ9Y266 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms