Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms