Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms