Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms