Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms