Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms