Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ11

ATP13A2, Cation-transporting ATPase 13A2, humanhuman

Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A2Q9NQ11 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP13A2Q9NQ11 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms