Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms