Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
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