Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVV2

FNDC11, Fibronectin type III domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC11Q9BVV2 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms