Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP4Q99569 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP4Q99569 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP4Q99569 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP4Q99569 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP4Q99569 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP4Q99569 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP4Q99569 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP4Q99569 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP4Q99569 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP4Q99569 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP4Q99569 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP4Q99569 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP4Q99569 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP4Q99569 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP4Q99569 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP4Q99569 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP4Q99569 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP4Q99569 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP4Q99569 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP4Q99569 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP4Q99569 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP4Q99569 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP4Q99569 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP4Q99569 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP4Q99569 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP4Q99569 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP4Q99569 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP4Q99569 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP4Q99569 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP4Q99569 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP4Q99569 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP4Q99569 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP4Q99569 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms