Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms